Établir un devis, transformer une commande en facture, relancer un client en retard, suivre ses encaissements : la facturation occupe une part non négligeable du temps d’un indépendant ou d’un dirigeant de TPE. Un tableur ou un traitement de texte suffit au démarrage, mais devient vite source d’erreurs et de retards de paiement.
Le sujet a pris une autre dimension avec la généralisation de la facturation électronique entre entreprises. Les factures ne peuvent plus être de simples PDF envoyés par e-mail : elles doivent être émises et reçues dans un format structuré, par l’intermédiaire d’une plateforme agréée par l’administration fiscale. Le choix du logiciel devient donc aussi une question de conformité.
Nous avons comparé neuf logiciels de facturation sur leur prix, leurs fonctionnalités, leur conformité à la facturation électronique et leur simplicité d’utilisation. Vous trouverez aussi les obligations à connaître et les critères pour choisir l’outil adapté à votre activité.
Logiciel de facturation : les chiffres clés
Notre méthodologie
Comment nous notons les logiciels de facturation
Chaque logiciel est noté sur 5 à partir de ses grilles tarifaires et descriptifs officiels, pour un usage type d’indépendant ou de TPE. Une information non publiée est comptée comme manquante.
Aucune note n’est influencée par nos partenariats commerciaux. Les liens affiliés n’altèrent jamais le classement.
Comparatif des meilleurs logiciels de facturation
| Logiciel | Note | Offre gratuite | Prix mensuel HT | Facturation électronique | Comptabilité intégrée | Offre |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Tiime | ★★★★★ 4,7 | 0 € | Dès 17,99 € | Plateforme agréée | ✓ | Voir l’offre |
| Indy | ★★★★☆ 4,4 | 0 € | Dès 9 € | Plateforme agréée | ✓ | Voir l’offre |
| Pennylane | ★★★★☆ 4,3 | 0 €* | Dès 7 € | Plateforme agréée | ✓ | Voir l’offre |
| Shine | ★★★★☆ 4,1 | 0 € | Dès 9 € | Plateforme agréée | ✕ | Voir l’offre |
| Abby | ★★★★☆ 4,0 | 0 € | Dès 9 € | Plateforme agréée | ✓ | Voir l’offre |
| Evoliz | ★★★★☆ 3,9 | — | Dès 29 € | Plateforme agréée | ✓ | Voir l’offre |
| Henrri | ★★★★☆ 3,7 | 0 € | Dès 17 € | Via plateforme partenaire | ✕ | Voir l’offre |
| Sellsy | ★★★☆☆ 3,2 | — | Dès 39 € | À vérifier | ✕ | Voir l’offre |
| Axonaut | ★★★☆☆ 3,0 | — | Dès 48,50 € | À vérifier | ✕ | Voir l’offre |
* L’offre gratuite de Pennylane est réservée aux micro-entreprises non assujetties à la TVA, avec un seul utilisateur. Les prix indiqués correspondent aux premières formules payantes, hors taxes, parfois avec engagement annuel. Les tarifs évoluent régulièrement : vérifiez-les sur le site de chaque éditeur.
Notre classement des meilleurs logiciels de facturation
Tiime
Une offre gratuite très complète, conforme à la facturation électronique, pensée pour gérer son activité depuis son téléphone.
Indy
Une solution gratuite qui relie facturation, banque et comptabilité, de la micro-entreprise à la SASU.
Pennylane
La référence pour les entreprises qui travaillent avec un expert-comptable, avec une comptabilité en temps réel.
Shine
Un outil de facturation simple et gratuit, avec émission et réception des factures électroniques sans surcoût.
Abby
Le spécialiste des micro-entrepreneurs, avec déclarations Urssaf et avance immédiate du crédit d’impôt pour les services à la personne.
Evoliz
Un logiciel complet et certifié pour les artisans, commerçants et TPE, plateforme agréée incluse dans toutes les formules.
Henrri
Un outil gratuit et sans limite de factures, qui s’appuie sur une plateforme partenaire pour la facturation électronique.
Sellsy
Une suite CRM et facturation pour les PME de services avec une équipe commerciale.
Axonaut
Un logiciel de gestion tout-en-un pour les structures qui veulent centraliser commercial, facturation et projets.
Vous voulez organiser la gestion de votre entreprise ?
Laissez vos coordonnées : un conseiller vous rappelle gratuitement pour faire le point sur votre gestion, votre trésorerie et vos projets. Sans engagement.
Les logiciels gratuits pour indépendants et micro-entreprises
Ces logiciels proposent une offre gratuite suffisante pour démarrer, avec des formules payantes à quelques euros par mois pour les fonctionnalités avancées. Ils conviennent aux freelances, micro-entrepreneurs et petites sociétés.
Tiime, la meilleure offre gratuite
Tiime propose une offre Free qui inclut devis et factures illimités, livre des recettes, comptabilité et rapprochement bancaire, ainsi que l’émission et la réception des factures électroniques. Les formules payantes, à partir de 17,99 euros HT par mois avec engagement annuel, ajoutent notamment le paiement en ligne et des fonctions de gestion plus poussées.
Ses applications mobiles permettent de tout gérer depuis un téléphone. Sa principale limite est de ne gérer que l’euro, ce qui pénalise les indépendants qui facturent des clients à l’étranger dans une autre devise.
Tiime, en bref
★★★★★- Offre gratuite : oui
- Payant : dès 17,99 € HT par mois
- E-facturation : plateforme agréée
- Prix : 5/5
- Fonctionnalités : 4/5
- E-facturation : 5/5
- Simplicité : 5/5
- Factures illimitées
- Applications mobiles
- Comptabilité incluse
Points forts
- Offre gratuite très complète
- Facturation électronique incluse sans surcoût
- Applications iOS et Android
Points faibles
- Facturation en euros uniquement
- Intégrations limitées
- Paiement en ligne réservé aux formules payantes
Indy, la facturation reliée à la comptabilité
Indy relie facturation, compte bancaire et comptabilité dans une même application. Son offre Essentiel est gratuite, et les formules payantes démarrent à 9 euros HT par mois en facturation annuelle. Il s’adresse aux indépendants comme aux sociétés, SASU, EURL ou SARL, mais aussi aux SCI et loueurs en meublé.
La synchronisation bancaire catégorise automatiquement les opérations, ce qui simplifie fortement la tenue comptable et les déclarations. Indy ne propose en revanche ni CRM ni suivi commercial. Notre guide de la banque pour auto-entrepreneur vous aide à choisir le compte à y connecter.
Indy, en bref
★★★★★- Offre gratuite : oui
- Payant : dès 9 € HT par mois
- E-facturation : plateforme agréée
- Prix : 5/5
- Fonctionnalités : 3/5
- E-facturation : 5/5
- Simplicité : 5/5
- Synchronisation bancaire
- Déclarations fiscales
- Sociétés et SCI acceptées
Points forts
- Offre gratuite avec comptabilité
- Synchronisation bancaire automatique
- Adapté aux sociétés et aux SCI
Points faibles
- Pas de CRM
- Peu adapté aux équipes commerciales
- Fonctions avancées payantes
Shine, l’outil de facturation simple et gratuit
Shine, connue pour son compte professionnel, propose aussi un outil de facturation en ligne. L’offre Free est gratuite, puis les formules démarrent à 9 euros HT par mois. Devis, factures et relances sont inclus, ainsi que l’émission et la réception des factures électroniques sans surcoût.
L’outil se distingue par sa simplicité, mais ne propose ni comptabilité complète ni CRM. Il convient aux indépendants et artisans qui veulent facturer rapidement et confient leur comptabilité à un professionnel.
Shine, en bref
★★★★★- Offre gratuite : oui
- Payant : dès 9 € HT par mois
- E-facturation : plateforme agréée
- Prix : 4,5/5
- Fonctionnalités : 2,5/5
- E-facturation : 5/5
- Simplicité : 5/5
- Relances incluses
- 100 % en ligne
- E-facture sans surcoût
Points forts
- Offre gratuite
- Prise en main immédiate
- Facturation électronique sans surcoût
Points faibles
- Pas de comptabilité complète
- Pas de CRM
- Fonctions limitées pour une PME
Abby, le spécialiste des micro-entrepreneurs
Abby est conçu pour les micro-entrepreneurs, freelances, artisans et professions libérales. Son offre Basique est gratuite, et la formule Start coûte 9 euros HT par mois en facturation annuelle. Il tient les livres des recettes et des achats, et permet de déclarer et payer ses cotisations Urssaf directement depuis l’outil.
Il propose aussi l’avance immédiate du crédit d’impôt pour les services à la personne, un vrai atout pour ce secteur. L’offre gratuite reste limitée : elle n’envoie pas les documents par e-mail et affiche la mention de l’éditeur.
Abby, en bref
★★★★★- Offre gratuite : oui, limitée
- Payant : dès 9 € HT par mois
- E-facturation : plateforme agréée
- Prix : 4/5
- Fonctionnalités : 3/5
- E-facturation : 5/5
- Simplicité : 4,5/5
- Déclarations Urssaf
- Avance du crédit d’impôt SAP
- Livres comptables
Points forts
- Déclarations Urssaf intégrées
- Avance immédiate pour les services à la personne
- Formule payante abordable
Points faibles
- Offre gratuite limitée
- Multi-utilisateurs réservé à la formule haute
- Moins adapté aux sociétés
Henrri, la facturation gratuite et illimitée
Henrri propose une offre Pro gratuite avec devis, factures et utilisateurs illimités, ainsi que l’export comptable. Les formules Expert et VIP, à partir de 17 euros HT par mois en facturation annuelle, ajoutent par exemple la signature électronique des devis. Le paiement des factures par QR code ou lien est possible, moyennant une commission.
Pour la facturation électronique, Henrri s’appuie sur une plateforme agréée partenaire. L’outil n’a pas d’application mobile native et les liaisons comptables passent par des exports de fichiers.
Henrri, en bref
★★★★★- Offre gratuite : oui
- Payant : dès 17 € HT par mois
- E-facturation : via plateforme partenaire
- Prix : 5/5
- Fonctionnalités : 2/5
- E-facturation : 4/5
- Simplicité : 4/5
- Factures illimitées
- Utilisateurs illimités
- Paiement par QR code
Points forts
- Gratuit et illimité
- Plusieurs utilisateurs sans surcoût
- Paiement en ligne possible
Points faibles
- Pas d’application mobile native
- Facturation électronique via un partenaire
- Liaisons comptables par export
Le conseil Aurigin
Un logiciel gratuit n’est pas forcément conforme. Vérifiez qu’il est immatriculé comme plateforme agréée ou relié à une plateforme agréée, et qu’il produit des factures dans un format structuré, et pas seulement en PDF.
Les logiciels pour TPE et PME avec comptabilité
Ces solutions vont plus loin que la facturation : gestion des achats, trésorerie, connexion avec l’expert-comptable. Elles conviennent aux entreprises qui ont des salariés, des fournisseurs nombreux ou un cabinet comptable.
Pennylane, la référence avec un expert-comptable
Pennylane combine facturation, synchronisation bancaire et production comptable, avec plus de soixante intégrations. Une offre gratuite existe pour les micro-entreprises non assujetties à la TVA, puis les formules démarrent à 7 euros HT par mois avec un compte professionnel partenaire. Les relances automatiques sont réservées aux formules intermédiaires.
Son principal atout est la collaboration en temps réel avec l’expert-comptable, qui accède directement aux pièces et aux écritures. Une grande partie de sa valeur dépend donc du cabinet, et certaines formules sont proposées via des cabinets partenaires.
Pennylane, en bref
★★★★★- Offre gratuite : micro sans TVA
- Payant : dès 7 € HT par mois
- E-facturation : plateforme agréée
- Prix : 4/5
- Fonctionnalités : 5/5
- E-facturation : 5/5
- Simplicité : 3/5
- Comptabilité en temps réel
- Plus de 60 intégrations
- Lien direct avec le comptable
Points forts
- Comptabilité et facturation réunies
- Collaboration avec l’expert-comptable
- Nombreuses intégrations
Points faibles
- Valeur liée au cabinet comptable
- Prise en main plus exigeante
- Offre gratuite très restreinte
Evoliz, le logiciel certifié pour les TPE
Evoliz s’adresse aux artisans, commerçants et prestataires de une à quinze personnes. Les formules démarrent à 29 euros HT par mois, avec un essai gratuit de quinze jours. Devis, factures, trésorerie et achats sont inclus, avec une reconnaissance automatique des factures fournisseurs.
La plateforme agréée est incluse dans toutes les formules, et le logiciel dispose des certifications NF 203 et NF 525, utiles pour les commerçants qui encaissent des particuliers. Evoliz ne produit ni liasse fiscale ni bilan, qui restent du ressort de l’expert-comptable.
Evoliz, en bref
★★★★★- Offre gratuite : essai de 15 jours
- Payant : dès 29 € HT par mois
- E-facturation : plateforme agréée
- Prix : 2,5/5
- Fonctionnalités : 4,5/5
- E-facturation : 5/5
- Simplicité : 4/5
- Certifications NF 203 et NF 525
- OCR des factures d’achat
- Trésorerie incluse
Points forts
- Plateforme agréée dans toutes les formules
- Certifications anti-fraude
- Gestion des achats et de la trésorerie
Points faibles
- Pas d’offre gratuite
- Pas de bilan ni de liasse fiscale
- Peu adapté aux besoins RH ou CRM avancés
Le conseil Aurigin
Si vous travaillez avec un expert-comptable, demandez-lui quel logiciel il utilise avant de choisir. Un outil connecté à son cabinet évite les ressaisies et réduit souvent le coût de la mission comptable.
Les suites CRM et ERP pour PME commerciales
Ces logiciels intègrent la facturation dans une gestion plus large : prospection, suivi commercial, projets. Ils s’adressent aux PME avec une équipe commerciale, et sont surdimensionnés pour un indépendant.
Sellsy, le CRM avec facturation intégrée
Sellsy réunit CRM et facturation dans une même base, avec facturation récurrente, relances et campagnes e-mail et SMS. Les formules démarrent à 39 euros HT par mois et par utilisateur. Les données sont hébergées en France.
Il prend tout son sens pour une PME de services avec une équipe commerciale de quelques personnes. Pour un artisan ou un indépendant, un outil de facturation pure sera bien moins cher. Vérifiez auprès de l’éditeur la plateforme agréée utilisée pour la facturation électronique.
Sellsy, en bref
★★★★★- Offre gratuite : non
- Payant : dès 39 € HT par utilisateur
- E-facturation : à vérifier
- Prix : 1,5/5
- Fonctionnalités : 4,5/5
- E-facturation : 3/5
- Simplicité : 4/5
- CRM intégré
- Facturation récurrente
- Hébergement en France
Points forts
- CRM et facturation dans un seul outil
- Facturation récurrente
- Campagnes e-mail et SMS
Points faibles
- Prix par utilisateur élevé
- Surdimensionné pour un indépendant
- Statut e-facturation à vérifier
Axonaut, le logiciel de gestion tout-en-un
Axonaut fonctionne comme un ERP léger : CRM, facturation, trésorerie, achats, projets, ressources humaines et service après-vente. Il coûte 48,50 euros HT par mois et par utilisateur avec un engagement de deux ans, davantage sans engagement. Il s’intègre avec les principaux services de paiement.
Il convient aux agences et PME qui veulent centraliser toute leur gestion. Pour une simple activité de facturation, il est trop complet et trop coûteux. Comme pour Sellsy, renseignez-vous sur sa plateforme agréée.
Axonaut, en bref
★★★★★- Offre gratuite : essai
- Payant : dès 48,50 € HT par utilisateur
- E-facturation : à vérifier
- Prix : 1,5/5
- Fonctionnalités : 4,5/5
- E-facturation : 3/5
- Simplicité : 3/5
- CRM, projets et RH
- Intégrations de paiement
- Trésorerie et achats
Points forts
- Gestion complète de l’entreprise
- Nombreuses intégrations
- Suivi de projets et notes de frais
Points faibles
- Coûteux, surtout sans engagement
- Trop complet pour un indépendant
- Statut e-facturation à vérifier
Le conseil Aurigin
Un CRM n’a d’intérêt que si vous suivez une prospection active avec plusieurs commerciaux. Sinon, privilégiez un outil de facturation simple et connectez-le à votre banque et à votre comptable.
Faites le point sur la gestion de votre entreprise
Laissez vos coordonnées : un conseiller vous rappelle gratuitement pour échanger sur votre trésorerie, votre rémunération et vos projets de développement. Sans engagement.
La facturation électronique : ce qui change pour les entreprises
Avec la réforme de la facturation électronique, les factures entre entreprises assujetties à la TVA établies en France ne peuvent plus être de simples PDF. Elles doivent être émises et reçues dans un format structuré, comme Factur-X, UBL ou CII, par l’intermédiaire d’une plateforme agréée par l’administration fiscale. Ces plateformes transmettent aussi certaines données de facturation à l’administration.
La réception des factures électroniques est désormais obligatoire pour toutes les entreprises concernées. L’obligation d’émission s’applique progressivement, d’abord aux grandes entreprises et aux entreprises de taille intermédiaire, puis aux PME et micro-entreprises. Le calendrier ayant déjà été modifié, vérifiez les échéances en vigueur sur le site de l’administration fiscale.
Comment choisir son logiciel de facturation selon son profil
Un micro-entrepreneur ou un freelance qui débute trouvera son compte dans une offre gratuite et conforme, avec devis, factures et suivi des encaissements. S’il veut aussi gérer ses déclarations Urssaf ou sa comptabilité, il privilégiera un outil qui les intègre.
Une société avec un expert-comptable choisira de préférence un logiciel connecté à son cabinet. Une TPE qui encaisse des particuliers vérifiera les certifications anti-fraude. Une PME avec une équipe commerciale pourra opter pour une suite intégrant un CRM. Dans tous les cas, connectez le logiciel à votre compte bancaire : notre guide pour choisir sa néobanque présente les comptes les mieux intégrés.
Les mentions obligatoires d’une facture
Une facture doit comporter un numéro unique attribué selon une séquence chronologique et continue, la date d’émission, l’identité et l’adresse du vendeur et du client, le numéro SIREN, la désignation précise des produits ou services, les quantités, les prix unitaires hors taxes, le taux et le montant de TVA, ainsi que la date de paiement et les pénalités de retard.
La réforme ajoute de nouvelles mentions, comme le numéro SIREN du client, l’adresse de livraison si elle diffère de celle du client, ou la nature des opérations. Un bon logiciel les intègre automatiquement. Les factures doivent être conservées dix ans, et ne peuvent pas être supprimées ou modifiées une fois émises : une erreur se corrige par une facture d’avoir.
Profil : Marion, graphiste en micro-entreprise, émet une quinzaine de factures par mois et passe environ trois heures par mois à préparer ses documents sur un tableur et à relancer ses clients.
Solution : elle adopte un logiciel gratuit conforme à la facturation électronique, avec modèles de devis, transformation automatique en facture et relances programmées.
Résultat : ses documents sont prêts en quelques minutes, ses relances partent automatiquement et elle suit ses encaissements en temps réel. Elle reste conforme à la réforme sans surcoût.
Les erreurs à éviter en choisissant un logiciel de facturation
La première erreur consiste à choisir un outil uniquement parce qu’il est gratuit, sans vérifier sa conformité à la facturation électronique. La deuxième est de sous-estimer le coût réel : prix par utilisateur, engagement annuel, options payantes comme le paiement en ligne ou les relances. La troisième est de négliger l’export des données, qui conditionne la possibilité de changer de logiciel plus tard.
Pensez aussi à l’ensemble de votre gestion : un logiciel qui se connecte à votre banque et à votre comptable fait gagner bien plus de temps qu’un outil isolé. Enfin, comparez les frais de votre compte professionnel, souvent plus élevés que l’abonnement au logiciel : notre article sur les frais bancaires à éviter vous aide à faire le tri. Les indépendants trouveront aussi des pistes pour réduire leurs impôts en freelance.
Conclusion
Le meilleur logiciel de facturation dépend de la taille et de l’organisation de votre activité. Les indépendants et micro-entrepreneurs disposent aujourd’hui d’offres gratuites et conformes à la facturation électronique. Les sociétés accompagnées par un expert-comptable gagneront à choisir un outil connecté à leur cabinet, et les PME commerciales une suite intégrant un CRM.
Avant de vous décider, vérifiez le statut de plateforme agréée, testez l’outil pendant la période d’essai et assurez-vous de pouvoir exporter vos données. Les tarifs et fonctionnalités évoluent souvent : confirmez-les sur le site de chaque éditeur.
Questions fréquentes
Quel est le meilleur logiciel de facturation ?
Existe-t-il un logiciel de facturation gratuit et conforme ?
Qu’est-ce qu’une plateforme agréée de facturation électronique ?
Un micro-entrepreneur est-il concerné par la facturation électronique ?
Peut-on continuer à faire ses factures sur Word ou Excel ?
Combien coûte un logiciel de facturation ?
Résumé
- Tiime obtient la meilleure note avec une offre gratuite complète et conforme.
- Indy relie facturation, banque et comptabilité gratuitement.
- Pennylane est la référence pour les entreprises accompagnées par un expert-comptable.
- Shine, Abby et Henrri proposent aussi des offres gratuites adaptées aux indépendants.
- La facturation électronique impose un format structuré et une plateforme agréée.
- Les factures doivent être conservées dix ans et numérotées de façon continue.
- Sellsy et Axonaut s’adressent aux PME avec une équipe commerciale.
À retenir
- Vérifiez le statut de plateforme agréée avant de choisir.
- Une offre gratuite peut suffire pour un indépendant.
- Connectez le logiciel à votre banque et à votre comptable.
- Comparez le coût réel : utilisateurs, engagement, options.
- Assurez-vous de pouvoir exporter vos données.
Sources
- Grilles tarifaires et descriptifs officiels de Tiime, Indy, Pennylane, Shine, Abby, Evoliz, Henrri, Sellsy et Axonaut
- Impots.gouv.fr, facturation électronique et liste des plateformes agréées
- Légifrance, Code général des impôts, article 242 nonies A relatif aux mentions obligatoires des factures
- Service-public.fr, fiches sur la facturation entre professionnels et la conservation des documents
